历史进程
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1993年12月丁大钊、方守贤、冼鼎昌三位中国科学院院士建议“在我国建设一台第三代同步辐射光源”。
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1994年3月中国科学院上海应用物理研究所（时名上海原子核研究所）向中国科学院和上海市人民政府提出了《关于在上海地区建设第三代同步辐射光源的建议报告》。
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1995年2月谢希德、杨福家和王志勤等政协委员在上海市政协八届三次会议上提交了“在上海建造第三代同步辐射光源”的提案。
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1995年3月中国科学院和上海市人民政府商定，共同向国家建议，在上海建设一台第三代同步辐射装置。
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1995年6月中国科学院将该项目暂定名为“上海同步辐射装置（Shanghai Synchrotron Radiation Facility，简称为SSRF）”，并成立了“上海同步辐射装置”可行性研究工作组。
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1997年4月23日中国科学院与上海市政府共同研究，决定成立“上海同步辐射装置（预制研究）工程指挥部（筹）”。
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1997年6月国家科技领导小组批准开展上海同步辐射装置预制研究。
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1998年3月国家计委于正式批准SSRF工程的预制研究。
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1999年1月至2001年3月实施了上海同步辐射装置预制研究项目。
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2002年7月至2004年12月实施了上海同步辐射装置工程二期预制研究项目。
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2003年7月中国科学院和上海市人民政府向国家发展改革委上报了上海光源工程项目建议书。
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2004年1月国务院第34次常务会议批准通过了上海光源工程项目建议书。
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2004年11月15日国家发展改革委批复上海光源项目可行性研究报告。
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2004年12月24日国家发展改革委批复上海光源国家重大科学工程初步设计和投资概算，中国科学院批复上海光源国家重大科学工程开工报告。
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2004年12月25日上海光源工程正式破土动工。
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2007年5月15日直线加速器启动总体调试；6月28日，各项技术指标都基本达到设计要求。
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2007年9月30日增强器启动调束；10月30日，增强器成功实现了3.5GeV电子束引出。
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2007年12月21日储存环启动调束；12月24日，储存环成功实现了3GeV电子束储存，并在光束线前端区观测到了同步辐射光——在开工三周年之际，上海光源出光！
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2009年3月7日上海光源首批7条光束线站全部完成通光调束工作。
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2009年4月26-27日工程指挥部组织了国际专家评估会，34位国内外中能光源的专家参加评审。评审结果表明，上海光源各项指标均达到或优于设计指标，达到同类装置世界一流水平。
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2009年4月29日上海光源工程顺利竣工。
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2009年5月6日上海光源正式对国内用户开放试运行。
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2010年1月19日上海光源工程顺利通过国家验收。
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2011年2月X射线自由电子激光试验装置项目由国家发展和改革委批准正式立项。
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2014年12月30日X射线自由电子激光试验装置正式开工建设。
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2016年11月20日上海光源线站工程（二期工程）、上海软X射线自由电子激光用户装置、活细胞结构与功能成像等线站工程开工。
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2016年12月30日X射线自由电子激光试验装置实现首次X射线出光。
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2017年4月28日硬X射线自由电子激光装置项目由国家发展和改革委批准正式立项。
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2018年4月27日硬X射线自由电子激光装置项目正式开工建设。
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2019年12月5日上海光源线站工程的硬X射线通用谱学线站、X光学测试线、用户数据中心通过了中国科学院组织的工艺测试验收，开始对用户开放试运行。
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2020年11月4日X射线自由电子激光试验装置项目正式通过国家验收。
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2022年1月26日活细胞结构与功能成像等线站工程顺利通过上海市验收/项目后评估验收。
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2022年9月7日上海软X射线自由电子激光用户装置顺利通过上海市验收/项目后评估验收。并正式对国内用户开放试运行。
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2023年9月19日上海光源线站工程通过工艺验收，标志着项目全部建设任务圆满完成。
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2024年5月15日上海光源线站工程通过国家验收。